El Museo del Estanquillo está ubicado en una de las esquinas más visitadas del Centro Histórico, en el entronque de las calles de Isabel la Católica y Madero. El edificio lleva por nombre La Esmeralda, porque albergaba, a fines del siglo XIX, a una de las más lujosas joyerías del país, conocida por el nombre de La Esmeralda Hauser-Zivy y compañía, especializada en la venta de selectas obras de arte, joyas, relojes y cajas de música.

El surgimiento de un museo a partir de la colección de Carlos Monsiváis era un hecho deseado por muchos, pues el material de su colección -sobre infinidad de temas- nutría de manera constante muchas exposiciones temporales en diversos recintos.

El Museo del Estanquillo pretende ser un regalo divertido para los mexicanos. Un espacio sin solemnidades en el que se puede encontrar arte en el más amplio sentido de la palabra; constatar los cambios físicos que ha sufrido la ciudad y reconocer en los objetos cotidianos el arte popular urbano.