El inmueble data de los primeros años del siglo XX. Es un edificio de estilo porfiriano, construido por órdenes del general Díaz en 1912 para ser ocupado por la prefectura política y municipal de Mixcoac.

La casa de cultura inició sus actividades como tal, en el año de 1975, razón por la cual, es considerada la primera casa de cultura de la Ciudad de México (es conocida en esa época como Casa de Cultura Mixcoac).

En 1986 se le nombra Centro Cultural Juan Rulfo, como homenaje póstumo al escritor mexicano.